DNBelab C系列平台基于液滴微流控策略,可以实现高效细胞捕获,完成高效的mRNA反转录和扩增后,结合华大DNBSEQ™高通量测序平台和Dr. Tom单细胞全交互式数据挖掘交付系统,进行高性价比单细胞转录组文库测序和数据分析挖掘,可广泛应用于研究免疫细胞、肿瘤微环境、神经系统发育及胚胎发育和干细胞分化等。
图1 DNBelab C- TaiM4
产品优势
1. 稀有细胞高效捕:高效捕获稀有类型细胞,实现新突破;
2. 多种样本无挑剔:除常规活细胞悬液外,珍稀液氮速冻样本可实现细胞核水平研究;
3. 测序数据高保真:搭配DNBSEQ™测序系统,不怕单个细胞数据弄混;
4. 自主分析不求人:Dr. Tom交互式单细胞数据挖掘系统支持;
5. 服务模式一站达:流式分选服务服务助力目的细胞分选,一站式实现从组织到细胞数据获取及细胞群验证。
产品性能
将两种不同状态的人多功能干细胞(PPSCs以及NPSCs)以99:1的比例混合后,进行DNBelab C系列平台单细胞RNA文库制备和测序,最后鉴定到NPSCs细胞比例为1.3%,表明该平台具备可靠的罕见细胞捕获能力。
图2 各类细胞分选检出比例
采用液氮速冻的肺组织样本,提取细胞核,进行DNBelab C系列平台单细胞分选建库及测序,共获得12,822个细胞核,每个细胞核检测基因数中位数1,000以上,助力珍稀样本实现单细胞(核)水平研究。
图3 液氮速冻肺组织样本提取细胞核分选结果展示
DNBelab C 系列平台对人外周血 PBMC 样本进行高效细胞分选和转录组建库测序,所得单细胞数据 UMAP 降维分群后,与 2020 年 Nature Biotechnology 已发表文章中人 PBMC 细胞分类及注释结果均一致[1]。
图4 DNBelab C系列平台的细胞分群对比
截止 2024 年 9 月,DNBelab C 系列单细胞平台累计发表 100 篇 SCI 文章,包含 4 篇 Nature,2 篇 Cell,平均影响因子 12+,其中 IF>10 文章数有 45 篇。
实验流程
图5 DNBelab C系列平台单细胞技术实验全流程
产品类型
标准通量——预计产出5,000-10,000个单细胞/样本
*以上版本均包含建库、测序和Dr. Tom标准分析
测序策略
推荐DNBSEQ™平台测序:
测序策略:PE100
测序深度:推荐平均50k reads/cell
生信分析内容
图6 信息分析思路图